После инсталляции WSUS 3.0 SP2 через Server Manager на Windows Server 2008 R2 столкнулся с проблемой - мастер настройки не запускается и к WSUS невозможно подключиться через консоль. При этом в Event Viewer фиксируются ошибки с номерами 12002, 12012, 12032, 12022, 12042, 12052. Причина оказалась довольно банальна - не соблюдены некоторые требования (ссылка на требования http://technet.microsoft.com/en-us/library/dd939916%28WS.10%29.aspx) для инсталляции, а именно NETWORK AUTHORITY/NETWORK SERVICE должна иметь полные права на следующие папки:

%windir%\Microsoft .NET\Framework\v2.0.50727\Temporary ASP.NET Files

%windir%\Temp

После добавления прав все чудесным образом заработало. RTFM!